Adrien Barton

Adrien Barton holds master-level degrees in mathematics and physics (Ecole Normale Supérieure de Lyon), as well as a PhD in philosophy of sciences (University Paris 1 Panthéon – Sorbonne). He is an associate researcher at the Interdisciplinary research group on medical computer science (GRIIS).

His current research concerns applied ontology and applied ethics. Applied ontology is an interdisciplinary research field that aims at representing reality by using logical and computer tools. It enables information exchange between various data sources in order to support, among others, the development of learning health systems fostering personalized medicine. Applied ontology and philosophical ontology benefit from each other when they aim at representing, for example, similarity, identity, change, causality, probability and part/whole relations (mereology). Applied ontology also interacts with philosophy of sciences when it aims at representing, for example, diseases, medical risks and biophysical entities. His research in applied ethics currently focuses on the question of consent to secondary use of clinical data for medical research.

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Publications

Journals:

1.
Ethier J-F, Barton A, Taseen R. An ontological analysis of drug prescriptions. Applied Ontology [Internet]. 2018 Nov 9;13(4):273–94.
1.
Barton A, Ethier J-F, Duvauferrier R, Burgun A. An ontological analysis of medical Bayesian indicators of performance. Journal of Biomedical Semantics [Internet]. 2017 Jan 3;8(1).
1.
Ethier J-F, McGilchrist MM, Barton A, Cloutier A-M, Curcin V, Delaney BC, Burgun A. The TRANSFoRm project: Experience and lessons learned regarding functional and interoperability requirements to support primary care. Learn Health Sys [Internet]. 2017;
1.
Barton A, Jebari K. Le libre-arbitre dans l'interprétation d'Everett de la mécanique quantique. Igitur [Internet]. 2017;8(2):1–11.
1.
Barton A, Rosier A. Ontologies appliquées biomédicales et ontologie philosophique : un développement complémentaire. In: Lato Sensu [Internet]. 2016. p. 1–8.
1.
Barton A, Grüne-Yanoff T. From Libertarian Paternalism to Nudging—and Beyond. RevPhilPsych [Internet]. 2015 Sep;6(3):341–59.
1.
Ethier J-F, Curcin V, Barton A, McGilchrist MM, Bastiaens H, Andreasson A, Rossiter J, Zhao L, Arvanitis TN, Taweel A, Delaney BC, Burgun A. Clinical data integration model. Core interoperability ontology for research using primary care data. Methods Inf Med [Internet]. 2015;54(1):16–23.
1.
Barton A. How Tobacco Health Warnings Can Foster Autonomy. Public Health Ethics [Internet]. 2013;6(2):207–19.
1.
Barton A. Définition et éthique du paternalisme libertarien. Implications philosophiques [Internet]. 2013;31–56.

Peer-reviewed international conference proceedings:

1.
Barton A, Duncan W, Toyoshima F, Ethier J-F. First Steps Towards an Ontology of Belief. In: The Joint Ontology Workshops JOWO 2018 [Internet]. Cape Town, Afrique du Sud; 2018.
1.
Barton A, Khnaisser C, Lavoie L, Ethier J-F. Ambiguities in Medical Bitemporalized Relational Databases: a Referent Tracking View. In: Proceedings of the Joint Ontology Workshops 2017, CEUR Workshop proceedings [Internet]. Bolzano, Italie: Boeker, M., Herre, H., Jansen, L., Loebe, F., & Shober, D.; 2018. p. 1–5.
1.
Barton A, Jansen L, Ethier J-F. A Taxonomy of Disposition-Parthood. In: Proceedings of the Joint Ontology Workshops 2017, CEUR Workshop proceedings [Internet]. Bolzano, Italie: Galton, A. & Neuhaus, F.; 2018. p. 1–10.
1.
Barton A, Jansen L, Rosier A, Ethier J-F. What is a risk? A formal representation of risk of stroke for people with atrial fibrillation. In: Proceedings of the 8th International Conference on Biomedical Ontology (ICBO-2017) [Internet]. Newcastle upon Tyn, Royaume-Uni; 2018.
1.
Barton A, Ethier J-F. The Two Ontological Faces of Velocity. In: Formal Ontology in Information Systems: Proceedings of the 9th International Conference (FOIS 2016) [Internet]. IOS Press; 2016. p. 123–36.
1.
Ethier J-F, Taseen R, Lavoie L, Barton A. Improving the Semantics of Drug Prescriptions with a Realist Ontology. In: Proceding of the Joint International Conference on Biological Ontology and BioCreative [Internet]. Oregon, États-Unis; 2016.
1.
Barton A, Jansen L. A modelling pattern for multi-track dispositions for life-science ontologies. In: Ontologies and Data in Life Sciences [Internet]. 2016. p. H1-2.
1.
Barton A, Duvauferrier R, Burgun A. Formalization of indicators of diagnostic performance in a realist ontology. In: Proceedings of 6th International Conference on Biomedical Ontology (ICBO 2015) [Internet]. 2015. p. 63–70.
1.
Barton A, Rosier A, Burgun A, Ethier J-F. The Cardiovascular Disease Ontology. In: Proceedings of the 8th conference on Formal Ontology in Information Systems (FOIS) [Internet]. IOS Press; 2014. p. 409–414.
1.
Barton A, Rovetto R, Mizoguchi R. Newtonian forces and causation: A dispositional account. In: Proceedings of the 8th conference Formal Ontology in Information Systems (FOIS) [Internet]. IOS Press; 2014. p. 157–70.
1.
Barton A, Grenier O, Jansen L, Ethier J-F. The identity of dispositions. In: Proceedings of the 10th International Conference on Formal Ontology in Information Systems (FOIS-2018). Accepté. p. 1–14.
1.
Barton A, Duncan W, Toyoshima F, Ethier J-F. Towards an ontology of belief. In: Proceedings of the Joint Ontology Workshops 2018. Accepté. p. 1–5.
1.
Barton A, Grenier O, Etier J-F. The Identity and mereology of pathological dispositions. In: Proceedings of the 9th International Conference on Biomedical Ontology (ICBO 2018). Accepté. p. 1–6.

Presentations:

1.
Barton A, Taseen R, Ethier J-F. PDRO: une ontologie des prescriptions médicales. Séminaire LAGON, Université Rennes 1; 2017; Rennes, France.
1.
Barton A. Introduction à l’ontologie appliquée. Séminaire du GRIIS, Université de Sherbrooke; 2017; Sherbrooke, Canada.
1.
Barton A. L’ontologie appliquée: Un outil pour résoudre le problème de Babel de l’information médicale. Séminaire avec la Direction des ressources informationnelles et des technologies du CIUSSS de l’Estrie - CHUS; 2017; Sherbrooke, Canada.
1.
Taseen R, Ethier J-F, Barton A. On prescribing drug prescriptions. Vaccine and Drug Ontology Studies workshop (VDOS-2016); 2016 Aug 1; Oregon, États-Unis.
1.
Barton A, Taseen R, Ethier J-F. PDRO: une ontologie des prescriptions médicales. Séminaire avec les responsables du Dossier Santé Québec; 2016; Québec, Canada.
1.
Barton A, Taseen R, Ethier J-F. PDRO: une ontologie des prescriptions médicales. Département de biologie systémique; 2016; Rostock, Allemagne.
1.
Barton A, Taseen R, Ethier J-F. PDRO: une ontologie des prescriptions médicales. Séminaire du département d’informatique de l’Université de Sherbrooke; 2016; Sherbrooke, Canada.
1.
Barton A, Ethier J-F, Taseen R. Ontologies to support Learning Health Systems. Clinical Terminology Shock & Awe, 5th Annual Workshop of the Clinical and Translational Science Ontology Group; 2016; Buffalo, États-Unis.
1.
Barton A. Une ontologie dispositionnelle du changement. 6e congrès de la Société de Philosophie des Sciences; 2016; Lausanne, Suisse.
1.
Barton A. L’ontologie appliquée: Un outil pour résoudre le problème de Babel de l’information médicale. Journée scientifique du département de médecine, Université de Sherbrooke; 2016; Sherbrooke, Canada.
1.
Barton A, Grüne-Yanoff T. Du paternalisme libertarien aux nudges - et au-delà. Séminaire annuel du département d’obstétrique et de gynécologie de l’Université de Sherbrooke; 2016; Sherbrooke, Canada.
1.
Barton A, Taseen R, Ethier J-F. PDRO: une ontologie des prescriptions médicales. Séminaire CAPE, Université de Kyoto; 2015; Kyoto, Japon.
1.
Barton A. Introduction à l’ontologie appliquée. Séminaire de l’équipe Metis, Université de Sherbrooke; 2015; Sherbrooke, Canada.
1.
Barton A, Grüne-Yanoff T. Du paternalisme libertarien aux nudges - et au-delà. Séminaire de la chaire d’épistémologie pratique du département de philosophie de l’Université de Sherbrooke; 2015; Sherbrooke, Canada.
1.
Barton A. Newtonian forces and causation. Séminaire de l’ISIR (Institute of Scientific and Industrial Research), Université d’Osaka; 2014; Osaka, Japon.
1.
Rosier A, Barton A. Biomedical applied ontologies and the nature of disease. In: 5e congrès de la Société de Philosophie des Sciences. Lille, France; 2014.
1.
Barton A. How health tobacco warnings interfere with personal autonomy. Atelier d’éthique appliquée, Université Paris 1 - Panthéon Sorbonne; 2013; Paris, France.
1.
Barton A. Formalisation des probabilités diagnostiques dans les ontologies appliquées. Séminaire Probabilités, Décision, Incertitude, IHPST; 2013; Paris, France.
1.
Barton A. Formalisation des probabilités diagnostiques dans les ontologies appliquées. Séminaire du JAIST (Japan Advanced Institute of Science and Technology); 2013; Ishikawa, Japon.
1.
Barton A. Formalisation des probabilités diagnostiques dans les ontologies appliquées. Séminaire de l’unité u936 de l’INSERM, Université Rennes 1; 2012; Rennes, France.

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