Pr Jean-François Ethier

Le Pr Jean-François Ethier est clinicien-chercheur et professeur agrégé au département de médecine à l’Université de Sherbrooke. Il codirige également le Groupe de recherche interdisciplinaire en informatique de la santé (GRIIS.ca) et est membre à titre de chercheur associé de l’UMRS 1138 de l’INSERM à Paris. Diplômé de médecine interne de l’Université McGill, il a obtenu un doctorat en épidémiologie et Sciences de l’Information biomédicale de l’université Paris VI (Pierre & Marie Curie). Ses responsabilités en recherche incluent la direction de la composante Accès aux données de l’Unité Soutien SRAP du Québec et celle du développement TI de la plateforme canadienne de données de santé des IRSC.

Dans le cadre de ses recherches, Pr Ethier s’intéresse aux méthodes permettant de mettre le patient au centre des systèmes de recherche et d’aide à la décision (système de santé apprenant). Plus spécifiquement, il développe des méthodes d’interopérabilité sémantiques entre les systèmes de santé et de recherche, structure les entrepôts de données du domaine biomédical et développe de modèles de connaissances formels afin d’unir les données cliniques, génomiques, administratives et issues des appareils personnels connectés (quantified self).

Page Expertus de l’Université de Sherbrooke

Publications

Articles de journaux:

1.
Ethier J-F, Barton A, Taseen R. An ontological analysis of drug prescriptions. Applied Ontology [Internet]. 2018 Nov 9;13(4):273–94.
1.
Vanasse A, Courteau M, Ethier J-F. The "6W" multidimensional model of care trajectories for patients with chronic ambulatory care sensitive conditions and hospital readmissions. Public Health [Internet]. 2018 Feb 27;157:53–61.
1.
Khnaisser C, Lavoie L, Burgun A, Ethier J-F. Generating Relational Database using Ontology Review. International Journal of Advanced Computer Science and Applications (IJACSA) [Internet]. 2018;9(6).
1.
Ethier J-F, Curcin V, McGilchrist MM, Lim Choi Keung SN, Zhao L, Andreasson A, Bródka P, Michalski R, Arvanitis TN, Mastellos N, Burgun A, Delaney BC. eSource for clinical trials: Implementation and evaluation of a standards-based approach in a real world trial. International Journal of Medical Informatics [Internet]. 2017 Oct 1;106:17–24.
1.
Cossette B, Ethier J-F, Joly-Mischlich T, Bergeron J, Ricard G, Brazeau S, Caron M, Germain O, Payette H, Kaczorowski J, Levine M. Reduction in targeted potentially inappropriate medication use in elderly inpatients: a pragmatic randomized controlled trial. Eur J Clin Pharmacol [Internet]. 2017 Jul 17;73(10):1237–45.
1.
Barton A, Ethier J-F, Duvauferrier R, Burgun A. An ontological analysis of medical Bayesian indicators of performance. Journal of Biomedical Semantics [Internet]. 2017 Jan 3;8(1).
1.
Ethier J-F, McGilchrist MM, Barton A, Cloutier A-M, Curcin V, Delaney BC, Burgun A. The TRANSFoRm project: Experience and lessons learned regarding functional and interoperability requirements to support primary care. Learn Health Sys [Internet]. 2017;
1.
Cossette B, Bergeron J, Ricard G, Ethier J-F, Joly-Mischlich T, Levine M, Sene M, Mallet L, Lanthier L, Payette H, Rodrigue M-C, Brazeau S. Knowledge Translation Strategy to Reduce the Use of Potentially Inappropriate Medications in Hospitalized Elderly Adults. J Am Geriatr Soc [Internet]. 2016 Dec;64(12):2487–94.
1.
Delaney BC, Curcin V, Andreasson A, Arvanitis TN, Bastiaens H, Ethier J-F, Corrigan D, Kostopoulou O, Kuchinke W, McGilchrist MM, Royen P van, Wagner P. Translational Medicine and Patient Safety in Europe: TRANSFoRm Architecture for the Learning Health System in Europe. BioMed Research International [Internet]. 2015 Oct 11;2015:e961526.
1.
Ethier J-F, Curcin V, Barton A, McGilchrist MM, Bastiaens H, Andreasson A, Rossiter J, Zhao L, Arvanitis TN, Taweel A, Delaney BC, Burgun A. Clinical data integration model. Core interoperability ontology for research using primary care data. Methods Inf Med [Internet]. 2015;54(1):16–23.
1.
St-Arnaud C, Ethier J-F, Hamielec C, Bersten A, Guyatt G, Meade M, Zhou Q, Leclair M-A, Patel A, Lamontagne F. Prescribed targets for titration of vasopressors in septic shock: a retrospective cohort study. CMAJ Open [Internet]. 2013 Oct;1(4):E127-133.
1.
Ethier J-F, Dameron O, Curcin V, McGilchrist MM, Verheij RA, Arvanitis TN, Taweel A, Delaney BC, Burgun A. A unified structural/terminological interoperability framework based on LexEVS: application to TRANSFoRm. J Am Med Inform Assoc [Internet]. 2013 Oct;20(5):986–94.

Rapports et thèses:


Présentations:

1.
Ethier J-F. Quelles ontologies pour un système de santé apprenant ?​. Symposium : Les ontologies biomédicales appliquées – SPS 2018; 2018 Jul; Nantes, France.
1.
Ethier J-F. Accès aux données et système de santé apprenant: Atteindre le plein potentiel [Internet]. Symposium : L'accès aux données et les systèmes de santé apprenant; 2018 Apr; Longueuil, Canada.
1.
Ethier J-F. Learning health systems supporting primary care : LESSONS LEARNED AND OPPORTUNITIES. 30th Annual Health Policy Conference - The Systems Awaken; 2018 Mar; Vancouver, Canada.
1.
Ethier J-F. Plateforme apprenante pour la recherche en santé et services sociaux - PARS3 - Learning Health and Social Services Research Platform. Collège des médecins de famille du Canada; 2018 Feb; Toronto, Canada.
1.
Ethier J-F. Plateforme apprenante pour la recherche en santé et services sociaux - PARS3. Direction de la recherche - Centre de recherche du CHUM; 2018 Feb; Montréal, Canada.
1.
Ethier J-F. Plateforme apprenante pour la recherche en santé et services sociaux - PARS3. Réseau de recherche axée sur les pratiques de première ligne de l’Université de Sherbrooke; 2018 Feb; Sherbrooke, Canada.
1.
Ethier J-F. Plateforme apprenante pour la recherche en santé et services sociaux - PARS3. Département de médecine de famille et médecine d’urgence. Présentation aux directeurs d’UMF; 2017 Dec; Sherbrooke, Canada.
1.
Barton A, Taseen R, Ethier J-F. PDRO: une ontologie des prescriptions médicales. Séminaire LAGON, Université Rennes 1; 2017; Rennes, France.
1.
Ethier J-F. La plateforme de recherche apprenante en santé de l’Estrie: libérer le potentiel de nos données pour la recherche. Centre de recherche du CHUS; 2017; Sherbrooke, Canada.
1.
Ethier J-F. Système de recherche apprenant: défis éthiques. Comité d’éthique pour la recherche, CIUSSS de l’Estrie - CHUS; 2017; Sherbrooke, Canada.
1.
Ethier J-F. Développement d’un système de santé apprenant en Estrie. Sherbio; 2017; Sherbrooke, Canada.
1.
Ethier J-F. Système de recherche apprenant: Changement de paradigme et opportunités. INSERM UMRS 1138; 2017; Paris, France.
1.
Ethier J-F. La recherche à partir des dossiers médicaux électroniques (DMÉ) dans un système de santé apprenant : défis et opportunités [Internet]. 8e Journée d'étude des comités d'éthique de la recherche et de leurs partenaires; 2017; Quebec, Canada.
1.
Taseen R, Ethier J-F, Barton A. On prescribing drug prescriptions. Vaccine and Drug Ontology Studies workshop (VDOS-2016); 2016 Aug 1; Oregon, États-Unis.
1.
Barton A, Taseen R, Ethier J-F. PDRO: une ontologie des prescriptions médicales. Séminaire avec les responsables du Dossier Santé Québec; 2016; Québec, Canada.
1.
Barton A, Taseen R, Ethier J-F. PDRO: une ontologie des prescriptions médicales. Département de biologie systémique; 2016; Rostock, Allemagne.
1.
Barton A, Taseen R, Ethier J-F. PDRO: une ontologie des prescriptions médicales. Séminaire du département d’informatique de l’Université de Sherbrooke; 2016; Sherbrooke, Canada.
1.
Ethier J-F. Accès et partage des données des DMÉ au Québec: Vision, orientations, innovation. Journée de la recherche, département de médecine familiale, Université de Sherbrooke; 2016; Sherbrooke, Canada.
1.
Barton A, Ethier J-F, Taseen R. Ontologies to support Learning Health Systems. Clinical Terminology Shock & Awe, 5th Annual Workshop of the Clinical and Translational Science Ontology Group; 2016; Buffalo, États-Unis.
1.
Quirion R, Plante J-F, Rousseau L-M, Ethier J-F. À la recherche du patient au coeur des données massives // Looking for the patient at the core of big data [Internet]. Déjeuner du scientifique en chef du Québec à l'Assemblée Nationale. Présentation aux députés.; 2016; Québec, Canada.
1.
Ethier J-F. Learning Health Systems - New avenues. Farr Primary Care Conference; 2016; Swansea, Royaume-Uni.
1.
Barton A, Taseen R, Ethier J-F. PDRO: une ontologie des prescriptions médicales. Séminaire CAPE, Université de Kyoto; 2015; Kyoto, Japon.
1.
Ethier J-F. Les systèmes de santé apprenant: la recherche translationnelle sous l’angle des données de santé pragmatiques provenant du terrain. Conférence magistrale du département de médecine, Université de Sherbrooke; 2015; Sherbrooke, Canada.
1.
Ethier J-F. Learning Health Systems - LHS: La recherche translationnelle sous l’angle des données de santé pragmatiques provenant du terrain. Faculté de Pharmacie - Séminaire de l’axe Médicaments et santé des populations, Université de Montréal; 2015; Montréal, Canada.
1.
Ethier J-F. Les données de santé: comment les utiliser efficacement pour améliorer votre pratique, votre recherche. Journée scientifique 2015 des innovations en soins de première ligne au Québec; 2015; Montréal, Canada.
1.
Ethier J-F. Savoir c’est pouvoir. Les données de santé: comment les utiliser efficacement pour améliorer votre pratique, votre recherche. Conférence magistrale du département de médecine, Université de Montréal; 2014; Montréal, Canada.
1.
Curcin V, Arvanitis TN, Ethier J-F, Fraczkowsk K, Kazienko P, Brodka P, Andreasson A, Blizniuk G, Lim Choi Keung SN, Zhao L, Misiaszek A, McGilchrist MM, Delaney BC, Burgun A. Semantic approach to achieving interoperability between clinical care and clinical research [Internet]. New Routes for General Practice and Family Medicine - The 19th WONCA Europe Conference; 2014; Lisbon, Portugal.

Communications de conférence:

1.
Barton A, Duncan W, Toyoshima F, Ethier J-F. First Steps Towards an Ontology of Belief. In: The Joint Ontology Workshops JOWO 2018 [Internet]. Cape Town, Afrique du Sud; 2018.
1.
Barton A, Khnaisser C, Lavoie L, Ethier J-F. Ambiguities in Medical Bitemporalized Relational Databases: a Referent Tracking View. In: Proceedings of the Joint Ontology Workshops 2017, CEUR Workshop proceedings [Internet]. Bolzano, Italie: Boeker, M., Herre, H., Jansen, L., Loebe, F., & Shober, D.; 2018. p. 1–5.
1.
Barton A, Jansen L, Ethier J-F. A Taxonomy of Disposition-Parthood. In: Proceedings of the Joint Ontology Workshops 2017, CEUR Workshop proceedings [Internet]. Bolzano, Italie: Galton, A. & Neuhaus, F.; 2018. p. 1–10.
1.
Barton A, Jansen L, Rosier A, Ethier J-F. What is a risk? A formal representation of risk of stroke for people with atrial fibrillation. In: Proceedings of the 8th International Conference on Biomedical Ontology (ICBO-2017) [Internet]. Newcastle upon Tyn, Royaume-Uni; 2018.
1.
Cossette B, Ethier J-F, Joly-Mischlich T, Bergeron J, Ricard G, Brazeau S, Caron M, Germain O, Payette H, Kaczorowski J, Levine M. Reduction in potentially inappropriate medication use in elderly inpatients: a pragmatic randomized controlled trial. Annual Scientific Meeting of the American Geriatrics Society; 2017; San Antonio, États-Unis.
1.
Khnaisser C, Lavoie L, Ethier J-F. Unified Bitemporal Modelling Framework for Automatic Data Warehouse Design. In: 28th International Conference on Database and Expert Systems Applications DEXA 2017. Lyon, France; 2017.
1.
Liang SF, Porat T, Tapuria A, Ethier J-F, Delaney BC, Curcin V. A Dynamic Medical Terminology Mapping System – MeTMapS. In: Data Mining for Medical Informatics workshop [Internet]. Chicago, États-Unis; 2016.
1.
Liang SF, Ethier J-F, Porat T, Tapuria A, Delaney BC, Curcin V. MeTMapS-Medical terminology mapping system. In: 7th Workshop on Ontologies and Data in Life Sciences [Internet]. Halle, Allemagne; 2016.
1.
Beaulieu M-D, Boivin A, Dumez V, Ethier J-F, Kaczorowski J, Légaré F, Pluye P, Rhame E, Vanasse A, Bush P-L, Cloutier A-M, Fournier M, Gordie B, Zomahoun H. Implementing infrastructure for primary care patient oriented research: Challenges and opportunities [Internet]. Family Medicine Forum; 2016; Vancouver, Canada.
1.
Barton A, Ethier J-F. The Two Ontological Faces of Velocity. In: Formal Ontology in Information Systems: Proceedings of the 9th International Conference (FOIS 2016) [Internet]. IOS Press; 2016. p. 123–36.
1.
Ethier J-F, Taseen R, Lavoie L, Barton A. Improving the Semantics of Drug Prescriptions with a Realist Ontology. In: Proceding of the Joint International Conference on Biological Ontology and BioCreative [Internet]. Oregon, États-Unis; 2016.
1.
Khnaisser C, Lavoie L, Diab H, Ethier J-F. Data Warehouse Design Methods Review: Trends, Challenges and Future Directions for the Healthcare Domain. In: Morzy T, Valduriez P, Bellatreche L, editors. New Trends in Databases and Information Systems ADBIS 2015 Communications in Computer and Information Science [Internet]. Springer, Cham; 2015. p. 76–87.
1.
Lim Choi Keung SN, Zhao L, Arvanitis TN, Curcin V, Delaney BC, Ethier J-F, Burgun A, McGilchrist MM, Bródka P, Tuligowicz W, Andreasson A. TRANSFoRm: Implementing a Learning Healthcare System in Europe through Embedding Clinical Research into Clinical Practice. In: 2015 48th Hawaii International Conference on System Sciences [Internet]. Hawaii, États-Unis; 2015. p. 3176–85.
1.
Zhao L, Lim Choi Keung SN, Golby C, Ethier J-F, Curcin V, Bastiaens H, Burgun A, Delaney BC, Arvanitis TN. EU FP7 TRANSFoRm Project : query workbench for participant identification and data extraction. In: AMIA CRI 2015 [Internet]. San Francisco, États-Unis; 2015.
1.
Lim Choi Keung SN, Zhao L, Ethier J-F, Curcin V, Burgun A, Delaney BC, Arvanitis TN. Semantic enrichment of CDISC operational data model. In: AMIA Joint Summits on Translational Science proceedings AMIA Summit on Translational Science [Internet]. San Francisco, États-Unis: American Medical Informatics Association; 2015.
1.
Lim Choi Keung SN, Ethier J-F, Zhao L, Curcin V, Arvanitis T. The Integration Challenges in Bridging Patient Care and Clinical Research in a Learning Healthcare System. In: European Medical Informatics Conference [Internet]. Istanbul, Turquie; 2014.
1.
Lim Choi Keung SN, Zhao L, Rossiter J, McGilchrist M, Culross F, Ethier J-F, Burgun A, Verheij R, Khan N, Taweel A, Curcin V, Delaney BC, Arvanitis T. Detailed Clinical Modelling Approach to Data Extraction from Heterogeneous Data Sources for Clinical Research. In: AMIA Clinical Research Informatics Summit 2014, San Francisco, États-Unis [Internet]. San Francisco, États-Unis; 2014.
1.
Barton A, Rosier A, Burgun A, Ethier J-F. The Cardiovascular Disease Ontology. In: Proceedings of the 8th conference on Formal Ontology in Information Systems (FOIS) [Internet]. IOS Press; 2014. p. 409–414.
1.
Delaney BC, Ethier J-F, Curcin V, Corrigan D, Friedman C. International perspectives on the digital infrastructure for The Learning Healthcare System. In: Panel at AMIA annual symposium. Washington DC, États-Unis; 2013.
1.
Delaney BC, Ethier J-F, Taweel A, Arvanitis TN. Semantic Interoperability for Clinical Research in Europe. AMIA 2012 Summit on clinical Research Informatics; 2012; San Francisco, États-Unis.
1.
St-Arnaud C, Ethier J-F, Hamielec C, Leclair M-A, Lamontagne F. Prescribed targets for vasopressors titration in septic shock: a retrospective cohort study. In: European Society of Intensive Care Medicine. Berlin, Allemagne; 2011.
1.
Barton A, Grenier O, Jansen L, Ethier J-F. The identity of dispositions. In: Proceedings of the 10th International Conference on Formal Ontology in Information Systems (FOIS-2018). Accepté. p. 1–14.
1.
Barton A, Duncan W, Toyoshima F, Ethier J-F. Towards an ontology of belief. In: Proceedings of the Joint Ontology Workshops 2018. Accepté. p. 1–5.

Affiches: