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Jean-François Ethier

Jean-François Ethier - GRIIS - Groupe de recherche interdisciplinaire en informatique de la santé

Cofondateur et codirecteur scientifique du GRIIS

Professeur titulaire en médecine à l’Université de Sherbrooke

Titulaire de la Chaire de recherche en informatique de la santé de l’Université de Sherbrooke

Médecin titulaire au CHUS

Chercheur au Centre de recherche sur le vieillissement

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Jean-François Ethier est clinicien-chercheur et professeur titulaire au Département de médecine et au Département d’informatique de l’Université de Sherbrooke. Il pratique également comme médecin titulaire au Service de médecine interne du Centre hospitalier universitaire de Sherbrooke (CHUS).

Le professeur Jean-François Ethier dirige le développement technologique du Réseau de recherche sur les données de santé du Canada et codirige le groupe de recherche interdisciplinaire en informatique de la santé (GRIIS). Son programme de recherche se déploie aussi, en collaboration avec des collègues français, à travers ses travaux comme chercheur associé à l’INSERM. Cette collaboration a d’ailleurs permis la création du réseau franco-canadien Ensemble pour les maladies rares qu’il codirige avec la professeure Anita Burgun.

Les travaux de Jean-François Ethier explorent les enjeux autour des systèmes de santé apprenants (SSA). Ses recherches s’articulent plus précisément autour du développement de méthodes sécuritaires, éthiques et efficaces permettant l’utilisation des données de santé en contextes de soins, de recherche et de transfert de connaissances, et ce, à travers des outils d’aide à la décision et de pratique réflexive tels que ReflexD.

Positionner le citoyen au centre de ses données impose des changements radicaux en regard des processus d’accès aux données et des façons d’arrimer les différentes sources pour représenter pleinement les trajectoires de santé des patients, tant à l’intérieur du système de santé que dans la vie de tous les jours.

Le développement d’ontologies biomédicales est une composante essentielle de ce travail. Ces modèles de connaissances automatisables permettent la représentation de connaissances de façon non ambigüe et cohérente ce qui permet l’arrimage de différents modèles de données et sources hétérogènes pour un accès unifié.

Jean-François Ethier a participé au projet TRANSFoRm en Europe (projet financé par la Communauté européenne dans le cadre du programme FP7). TRANSFoRm a créé le premier prototype de SSA soutenant les soins et les services de santé en première ligne. Ces résultats ont servi de pierre d’assise pour le développement de la plateforme apprenante de recherche en santé et en services sociaux (PARS3), un système décentralisé et distribué, offert sous licence libre, qui permet l’utilisation sécuritaire de données (incluant l’analyse distribuée) sans nécessiter la centralisation des données en lot.

Formation

Ph. D., Université de Paris 6 — Pierre et Marie Curie, épidémiologie et sciences de l’information biomédicale

Master, Université de Rennes 1, santé publique

Spécialité en médecine interne générale, Université McGill

M.D.,C.M. (Doctor of medicine and master of surgery), Université McGill

Prix et distinctions

Prix Pierre-et-Danielle-Bourgaux, 2024

Liste d’honneur du doyen * implication académique dans le décile supérieur pour les professeurs, Université de Sherbrooke, 2017-2023

Chercheur-boursier Junior 2, Fonds de recherche du Québec – Santé (FRQS), 2023

Chercheur-boursier Junior 1 – informatique et santé, Fonds de recherche du Québec – Santé (FRQS), 2018

1er prix, concours d’ontologie, catégorie « Cardiovascular disease ontology », Formal Ontology in Information Systems, 2014

Liste honorifique du doyen, McGill University, 2006 et 2002

Bourse J. W. McConnell, McGill University, 2004 et 2002

Bourse James McGill, McGill University, 2001

Sociétés savantes

Collège royal des médecins et des chirurgiens du Canada

Membre des conseils d'administration

Institut d’information en santé du Canada

Supervision

Contenu relié

Québec

Propulser la recherche dans les systèmes de santé apprenants

2023-08-29

Les Fonds de recherche du Québec présentent les retombées des recherches effectuées par le Dr Ethier et le GRIIS qui ont développé PARS3, une infrastructure virtuelle mettant en réseau les données de soins de santé, et qui sera considérée dans le cadre du projet Dossier santé numérique.

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Publications

Bilodeau E, Cumyn A, Ménard J-F, Barton A, Dault R, Ethier J-F (2024) Utilisations secondaires des données de santé : impacts de la transparence. Can J Bioeth 7:118–137. https://doi.org/10.7202/1112284ar Cite
Andreasson A, Agréus L, Mastellos N, Bliźniuk G, Waśko-Czopnik D, Angelaki A, Theodosaki E, Lionis C, Hek K, Verheij R, Wright E, Durbaba S, Muris J, Bródka P, Saganowski S, Ethier J-F, Curcin V, Delaney B (2024) Effect of on-demand vs continuous prescription of proton pump inhibitors on symptom burden and quality of life: results of a real-world randomized controlled trial in primary care patients with gastroesophageal reflux disease. Annals of Medicine 56:2354683. Cite
Tarbouriech C, Vieu L, Barton A, Ethier J-F (2024) From slot mereology to a mereology of slots. Applied Ontology Preprint:1–50. https://doi.org/10.3233/AO-230051 Cite
Khnaisser C, Looten V, Lavoie L, Burgun A, Ethier J-F (2024) Building ontology-based temporal databases for data reuse: An applied example on hospital organizational structures. Health Informatics J 30. Cite
Cumyn A, Ménard J-F, Barton A, Dault R, Lévesque F, Ethier J-F (2023) Patients' and Members of the Public's Wishes Regarding Transparency in the Context of Secondary Use of Health Data: Scoping Review. J Med Internet Res 25:e45002. https://doi.org/10.2196/45002 Cite
Camirand Lemyre F, Lévesque S, Domingue M-P, Herrmann K, Ethier J-F (2023) Distributed Statistical Analyses: A Scoping Review and Examples of Operational Frameworks Adapted to Healthcare. medRxiv 2023.12.21.23300389. https://doi.org/10.1101/2023.12.21.23300389 Cite
Khnaisser C, Lavoie L, Fraikin B, Barton A, Dussault S, Burgun A, Ethier J-F (2022) Using an ontology to derive a sharable and interoperable relational data model for heterogeneous healthcare data and various applications. Methods Inf Med 61:e73–e88. https://doi.org/10.1055/a-1877-9498 Cite Download
McKay R, Letarte L, Lebel A, Quesnel-Vallée A, Vanasse A, Bartlett G, Blais L, Buckeridge D, Choinière M, Hudon C, Lacasse A, Lamarche B, Lebel A, Quesnel-Vallée A, Roberge P, Émond V, Pomey M-P, Benigeri M, Cloutier A-M, Dorais M, Courteau J, Courteau M, Plante S, Cambon P, Giguère A, Leroux I, St-Laurent D, Roy D, Borja J, Néron A, Landry G, Ethier J-F, Dault R, Côté-Marcil M-A, Tremblay P, Quirion S, on behalf of the TorSaDE Cohort Working Group (2022) Exploring social inequalities in healthcare trajectories following diagnosis of diabetes: a state sequence analysis of linked survey and administrative data. BMC Health Services Research 22:131. Cite
Toyoshima F, Barton A, Ethier J-F (2022) Affordances and their ontological core. Applied Ontology 17:285–320. Cite
Yousif A, Dault R, Courteau M, Blais L, Cloutier A-M, Lacasse A, Vanasse A, Bartlett G, Benigeri M, Blais L, Borja J, Buckeridge D, Choinière M, Côté-Marcil M-A, Courteau J, Courteau M, Dorais M, Dubé F, Ethier J-F, Émond V, Giguère A, Hudon C, Jean S, Lacasse A, Lamarche B, Lebel A, Leroux I, Néron A, Plante S, Pomey M-P, Quesnel-Vallée A, Quirion S, Rheaume J, Roberge P, Roy D, Tremblay P, on behalf of the TorSaDE Cohort Working Group (2022) The validity of diagnostic algorithms to identify asthma patients in healthcare administrative databases: a systematic literature review. J Asthma 59:152–168. https://doi.org/10.1080/02770903.2020.1827425 Cite
Dufour I, Vedel I, Quesnel-Vallée A, Vanasse A, Lebel A, Lacasse A, Néron A, Cloutier A-M, Giguère A, Lamarche B, Vissandjée B, Hudon C, St-Laurent D, Buckeridge D, Roy D, Landry G, Bartlett G, Blanchet G, Nguena Nguefack HL, Leroux I, Borja J, Ethier J-F, Courteau J, Blais L, Choinière M, Dorais M, Blanchette M-A, Côté-Marcil M-A, Fleury M-J, Pomey M-P, Benigeri M, Courteau M, Sourial N, Roberge P, Tremblay P, Cambon P, Dault R, Jean S, Quirion S, Plante S, Poder T, Émond V, on behalf of the TorSaDE Cohort Working Group (2022) Identification of Major Cognitive Disorders in Self-Reported versus Administrative Health Data: A Cohort Study in Quebec. Journal of Alzheimer’s Disease Preprint:1–11. https://doi.org/10.3233/JAD-220327 Cite
Letarte L, Samadoulougou S, McKay R, Quesnel-Vallée A, Waygood EOD, Lebel A, Vanasse A, Bartlett G, Blais L, Buckeridge D, Choinière M, Hudon C, Lacasse A, Lamarche B, Roberge P, Émond V, Pomey M-P, Benigeri M, Cloutier A-M, Dorais M, Courteau J, Courteau M, Plante S, Cambon P, Giguère A, Leroux I, St-Laurent D, Roy D, Borja J, Néron A, Landry G, Ethier J-F, Dault R, Côté-Marcil M-A, Tremblay P, Quirion S, TorSaDE Cohort Working Group (2022) Neighborhood deprivation and obesity: Sex-specific effects of cross-sectional, cumulative and residential trajectory indicators. Social Science & Medicine 306:115049. https://doi.org/https://doi.org/10.1016/j.socscimed.2022.115049 Cite
Madar H, Ghandour E-K, Perez J, Gauvin L, Ethier J-F, Pomey M-P (2022) Adherence to diabetes clinical practice guidelines to improve prevention and treatment of cardiovascular disease in Quebec: A retrospective cohort 2017-2020. Diabetes Epidemiology and Management 6:100053. https://doi.org/https://doi.org/10.1016/j.deman.2022.100053 Cite Download
Taseen R, Ethier J-F (2021) Expected clinical utility of automatable prediction models for improving palliative and end-of-life care outcomes: Toward routine decision analysis before implementation. Journal of the American Medical Informatics Association 28:2366–2378. Cite
Cumyn A, Dault R, Barton A, Cloutier A-M, Ethier J-F (2021) Citizens, Research Ethics Committee Members and Researchers' Attitude Toward Information and Consent for the Secondary Use of Health Data: Implications for Research Within Learning Health Systems. J Empir Res Hum Res Ethics 16:165–178. https://doi.org/10.1177/1556264621992214 Cite Download
Cumyn A, Barton A, Dault R, Safa N, Cloutier A-M, Ethier J-F (2021) Meta-consent for the secondary use of health data within a learning health system: a qualitative study of the public's perspective. BMC Med Ethics 22:81. Cite Download
Barton A, Cumyn A, Dault R, Ethier J-F (2021) Gift, Reciprocity and Learning Health Systems. Am J Bioeth 21:91–93. Cite
Ecarot T, Fraikin B, Lavoie L, McGilchrist M, Ethier J-F (2021) A Sensitive Data Access Model in Support of Learning Health Systems. Computers 10:25. https://doi.org/10.3390/computers10030025 Cite Download
Ethier J-F, Goyer F, Fabry P, Barton A (2021) The prescription of drug ontology 2.0 (PDRO): More than the sum of its parts. International Journal of Environmental Research and Public Health 18. https://doi.org/10.3390/ijerph182212025 Cite
Letarte L, Gagnon P, McKay R, Quesnel-Vallée A, Waygood EOD, Lebel A, Vanasse A, Bartlett G, Blais L, Buckeridge D, Choinière M, Hudon C, Lacasse A, Lamarche B, Quesnel-Vallée A, Roberge P, Émond V, Pomey M-P, Benigeri M, Cloutier A-M, Dorais M, Courteau J, Courteau M, Plante S, Cambon P, Giguère A, Leroux I, St-Laurent D, Roy D, Borja J, Néron A, Landry G, Ethier J-F, Dault R, Côté-Marcil M-A, Tremblay P, Quirion S, on behalf of the TorSaDE Cohort Working Group (2021) Examining longitudinal patterns of individual neighborhood deprivation trajectories in the province of Quebec: A sequence analysis application. Social Science & Medicine 288:113695. https://doi.org/https://doi.org/10.1016/j.socscimed.2021.113695 Cite
Dahl LT, Katz A, McGrail K, Diverty B, Ethier J-F, Gavin F, Mcdonald JT, Paprica PA, Schull M, Walker JD, Wu J (2020) The SPOR-Canadian Data Platform: a national initiative to facilitate data rich multi-jurisdictional research. International journal of population data science 5:1–9. https://doi.org/10.23889/ijpds.v5i1.1374 Cite Download
Lacasse A, Pagé MG, Choinière M, Dorais M, Vissandjée B, Nguefack HLN, Katz J, Samb OM, Vanasse A, Vanasse A, Bartlett G, Blais L, Buckeridge D, Choinière M, Hudon C, Lacasse A, Lamarche B, Lebel A, Quesnel-Vallée A, Roberge P, Émond V, Pomey M-P, Benigeri M, Cloutier A-M, Dorais M, Courteau J, Courteau M, Plante S, Cambon P, Giguère A, Leroux I, St-Laurent D, Roy D, Borja J, Néron A, Landry G, Ethier J-F, Dault R, Côté-Marcil M-A, Tremblay P, Quirion S, on behalf of the TorSaDE Cohort Working Group (2020) Conducting gender-based analysis of existing databases when self-reported gender data are unavailable: the GENDER Index in a working population. Canadian Journal of Public Health 111:155–168. Cite
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Cossette B, Taseen R, Roy-Petit J, Villemure M, Grondin M, Ricard G, Goyer F, Blanchard T, Ethier J-F (2018) Reduction in potentially inappropriate medication use in community-dwelling older adults followed by a Family Health Team. Journal of the American Geriatrics Society 66:S57–S57 Cite
Vanasse A, Courteau M, Ethier J-F (2018) The "6W" multidimensional model of care trajectories for patients with chronic ambulatory care sensitive conditions and hospital readmissions. Public Health 157:53–61. Cite Download
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Cossette B, Ethier J-F, Joly-Mischlich T, Bergeron J, Ricard G, Brazeau S, Caron M, Germain O, Payette H, Kaczorowski J, Levine M (2017) Reduction in targeted potentially inappropriate medication use in elderly inpatients: a pragmatic randomized controlled trial. Eur J Clin Pharmacol 73:1237–1245. https://doi.org/10.1007/s00228-017-2293-4 Cite
Barton A, Ethier J-F, Duvauferrier R, Burgun A (2017) An ontological analysis of medical Bayesian indicators of performance. J Biomed Semant 8:1. Cite Download
Cossette B, Bergeron J, Ricard G, Ethier J-F, Joly-Mischlich T, Levine M, Sene M, Mallet L, Lanthier L, Payette H, Rodrigue M-C, Brazeau S (2016) Knowledge translation strategy to reduce the use of potentially inappropriate medications in hospitalized elderly adults. J Am Geriatr Soc 64:2487–2494. https://doi.org/10.1111/jgs.14322 Cite
Ethier J-F, Curcin V, Barton A, McGilchrist MM, Bastiaens H, Andreasson A, Rossiter J, Zhao L, Arvanitis TN, Taweel A, Delaney BC, Burgun A (2015) Clinical data integration model: Core interoperability ontology for research using primary care data. Methods Inf Med 54:16–23. https://doi.org/10.3414/ME13-02-0024 Cite Download
Delaney BC, Curcin V, Andreasson A, Arvanitis TN, Bastiaens H, Corrigan D, Ethier J-F, Kostopoulou O, Kuchinke W, McGilchrist MM, van Royen P, Wagner P (2015) Translational medicine and patient safety in Europe: TRANSFoRm—Architecture for the learning health system in Europe. Biomed Res Int 2015:961526. https://doi.org/10.1155/2015/961526 Cite Download
St-Arnaud C, Ethier J-F, Hamielec C, Bersten A, Guyatt G, Meade M, Zhou Q, Leclair M-A, Patel A, Lamontagne F (2013) Prescribed targets for titration of vasopressors in septic shock: a retrospective cohort study. Canadian Medical Association Open Access Journal 1:E127–E133. Cite
Ethier J-F, Dameron O, Curcin V, McGilchrist MM, Verheij RA, Arvanitis TN, Taweel A, Delaney BC, Burgun A (2013) A unified structural/terminological interoperability framework based on LexEVS: application to TRANSFoRm. J Am Med Inform Assoc 20:986–994. https://doi.org/10.1136/amiajnl-2012-001312 Cite Download
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Khnaisser C, Lavoie L, Diab H, Ethier J-F (2015) Data warehouse design methods review: Trends, challenges and future directions for the healthcare domain. In: Morzy T, Valduriez P, Bellatreche L (eds) New Trends in Databases and Information Systems. Springer International Publishing, pp 76–87 Cite Download Download
Barton A, Fabry P, Ethier J-F (2024) Meaning Holism and Indeterminacy of Reference in Ontologies. In: Proceedings of the 14th International Conference on Formal Ontology Information Systems (FOIS 2024). Enschede, Pays-Bas Cite Download
Fabry P, Barton A, Ethier J-F (2023) Version control for interdependent ontologies: Challenges and first propositions. In: Proceedings of the International Conference on Biomedical Ontologies 2023 together with the Workshop on Ontologies for Infectious and Immune-Mediated Disease Data Science (OIIDDS 2023) and the FAIR Ontology Harmonization and TRUST Data Interoperability Workshop (FOHTI 2023). Brasilila, Brésil, pp 154–165 Cite
Goyer F, Fabry P, Barton A, Ethier J-F (2022) An ontology for healthcare systems. In: Proceedings of the 13th International Conference on Biomedical Ontology (ICBO 2022). Ann Arbor, États-Unis Cite
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Barton A, Tarbouriech C, Vieu L, Ethier J-F (2022) A Mereological System for Informational Templates. In: CEUR Workshop Proceedings Cite
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Barton A, Vieu L, Ethier J-F (2021) Expressions, Utterances and Directive Slots. In: Proceedings of the Joint Ontology Workshops 2021 (JOWO 2021). CEUR Workshop Proceedings, Bolzano, Italie Cite Download
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Tarbouriech C, Bernard D, Vieu L, Barton A, Ethier J-F (2021) Flight Procedures Description Using Semantic Roles. In: Proceedings of the Joint Ontology Workshops 2021 (JOWO 2021). CEUR Workshop Proceedings Cite
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