Jean-François Ethier

Jean-François Ethier - GRIIS - Groupe de recherche interdisciplinaire en informatique de la santé

Cofondateur et codirecteur scientifique du GRIIS

Professeur agrégé en médecine à l’Université de Sherbrooke

Médecin titulaire au CHUS

Directeur de la composante Accès aux données de l’Unité de soutien à la Stratégie de recherche axée sur le patient du Québec

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Clinicien chercheur et professeur agrégé au département de médecine et d’informatique à l’Université de Sherbrooke, le docteur Jean-François Ethier est codirecteur scientifique du GRIIS. Il dirige la composante Accès aux données de la Stratégie de recher­che axée sur le patient (SRAP) du Québec et le développement technologique de la plateforme canadienne de données de santé des IRSC.

Jean-François Ethier est chercheur associé de l’Unité 1138 Centre de recherche des Cordeliers de l’INSERM et de l’Université Paris Descartes, et du Centre de recherche du Centre hospitalier de l’Université de Sherbrooke. Il est spécialiste en médecine interne générale.

Les travaux de Jean-François Ethier portent sur les systèmes de santé apprenants. Plus particulièrement, il se concentre sur les méthodes d’accès aux données de santé, les systèmes de recherche et les outils d’aide à la décision clinique où les citoyens jouent des rôles actifs. Il développe des approches théoriques et des outils concrets pour que les systèmes d’information et de recherche puissent communiquer entre eux.

Ses activités de recherche influencent les manières de structurer les entrepôts de données biomédicales. Elles permettent aussi de combiner des données de santé variées qui sont stockées dans des systèmes informatiques qui fonctionnent différemment.

Jean-François Ethier développe des ontologies et des terminologies biomédicales. Celles-ci intègrent des bases de données diversifiées et hétérogènes au sein d’un réseau de données unifié. Ces solutions facilitent les flux d’informations entre les sciences et la pratique clinique. Elles propulsent la recherche en santé tout en accompagnant les professionnels de la santé qui prennent chaque jour de nombreuses décisions cliniques.

Jean-François Ethier a participé au développement du projet TRANSFoRm en Europe (projet financé par la Communauté européenne dans le cadre du programme FP7). TRANSFoRm a créé un prototype de système de santé apprenant pour soutenir les soins et les services de santé en première ligne.

Formation

Ph. D., Université de Paris 6 — Pierre et Marie Curie, épidémiologie et sciences de l’information biomédicale

Master, Université de Rennes 1, santé publique

Spécialité en médecine interne générale, Université McGill

M.D.,C.M. (Doctor of medicine and master of surgery), Université McGill

Prix et distinctions

1er prix, concours d’ontologie, catégorie « Cardiovascular disease ontology », Formal Ontology in Information Systems, 2014

Liste honorifique du doyen, McGill University, 2006 et 2002

Bourse J. W. McConnell, McGill University, 2004 et 2002

Bourse James McGill, McGill University, 2001

Sociétés savantes

Collège royal des médecins et des chirurgiens du Canada

Membre des conseils d'administration

Génome Québec

Supervision

Publications

Dahl L, Katz A, Mcgrail K, Diverty B, Ethier J-F, Gavin F, Mcdonald J, Paprica P, Schull M, Walker J, Wu J (2020) The SPOR-Canadian Data Platform: a national initiative to facilitate data rich multi-jurisdictional research. 5:1–9 . https://doi.org/10.23889/ijpds.v5i1.1374 Cite Download
Cumyn A, Barton A, Dault R, Cloutier A-M, Jalbert R, Ethier J-F (2019) Informed consent within a learning health system: A scoping review. Learning Health Systems. https://doi.org/10.1002/lrh2.10206 Cite Download
Khnaisser C, Lavoie L, Fraikin B, Barton A, Burgun A, Ethier J-F (2019) Advanced ontology-driven relational database generation for heterogeneous data : Ontorelα. Journal on Data Semantics (JODS) [Submitted 2019-09-20] Cite
Khnaisser C, Looten V, Lavoie L, Ethier J-F, Burgun A (2019) Combining ontology and temporal databases for data reuse: the example of hospital organizational structures. International Journal of Medical Informatics (IJMI) [To be publised] Cite
Ethier J-F, McGilchrist M, Barton A, Cloutier A-M, Curcin V, Delaney BC, Burgun A (2018) The TRANSFoRm project: Experience and lessons learned regarding functional and  interoperability requirements to support primary care. Learn Health Syst 2:e10037 . https://doi.org/10.1002/lrh2.10037 Cite
Vanasse A, Courteau M, Ethier J-F (2018) The 6W multidimensional model of care trajectories for patients with chronic ambulatory care sensitive conditions and hospital readmissions. Public Health 157:53–61 . https://doi.org/10.1016/j.puhe.2018.01.007 Cite Download
Ethier J-F, Barton A, Taseen R (2018) An ontological analysis of drug prescriptions. Applied Ontology 13:273–294 . https://doi.org/10.3233/AO-180202 Cite Download
Khnaisser C, Lavoie L, Burgun A, Ethier J-F (2018) Generating relational database using ontology review : Issues, challenges and trends. International Journal of Advanced Computer Science and Applications (IJACSA) 9: . https://doi.org/10.14569/IJACSA.2018.090620 Cite Download
Barton A, Ethier J-F, Duvauferrier R, Burgun A (2017) An ontological analysis of medical Bayesian indicators of performance. J Biomed Semantics 8:1 . https://doi.org/10.1186/s13326-016-0099-4 Cite
Cossette B, Ethier J-F, Joly-Mischlich T, Bergeron J, Ricard G, Brazeau S, Caron M, Germain O, Payette H, Kaczorowski J, Levine M (2017) Reduction in targeted potentially inappropriate medication use in elderly inpatients: a pragmatic randomized controlled trial. Eur J Clin Pharmacol 73:1237–1245 . https://doi.org/10.1007/s00228-017-2293-4 Cite
Ethier J-F, Curcin V, McGilchrist MM, Lim Choi Keung SN, Zhao L, Andreasson A, Bródka P, Michalski R, Arvanitis TN, Mastellos N, Burgun A, Delaney BC (2017) eSource for clinical trials: Implementation and evaluation of a standards-based approach in a real world trial. Int J Med Inform 106:17–24 . https://doi.org/10.1016/j.ijmedinf.2017.06.006 Cite Download Download
Barton A, Ethier J-F, Duvauferrier R, Burgun A (2017) An ontological analysis of medical Bayesian indicators of performance. J Biomed Semant 8:1 . Cite Download
Ethier J-F, McGilchrist MM, Barton A, Cloutier A-M, Curcin V, Delaney BC, Burgun A (2017) The TRANSFoRm project: Experience and lessons learned regarding functional and interoperability requirements to support primary care. Learn Health Sys. https://doi.org/10.1002/lrh2.10037 Cite Download
Cossette B, Bergeron J, Ricard G, Ethier J-F, Joly-Mischlich T, Levine M, Sene M, Mallet L, Lanthier L, Payette H, Rodrigue M-C, Brazeau S (2016) Knowledge translation strategy to reduce the use of potentially inappropriate medications in hospitalized elderly adults. J Am Geriatr Soc 64:2487–2494 . https://doi.org/10.1111/jgs.14322 Cite
Delaney BC, Curcin V, Andreasson A, Arvanitis TN, Bastiaens H, Corrigan D, Ethier J-F, Kostopoulou O, Kuchinke W, McGilchrist MM, van Royen P, Wagner P (2015) Translational medicine and patient safety in Europe: TRANSFoRm—Architecture for the learning health system in Europe. Biomed Res Int 2015:961526 . https://doi.org/10.1155/2015/961526 Cite Download
Ethier J-F, Curcin V, Barton A, McGilchrist MM, Bastiaens H, Andreasson A, Rossiter J, Zhao L, Arvanitis TN, Taweel A, Delaney BC, Burgun A (2015) Clinical data integration model: Core interoperability ontology for research using primary care data. Methods Inf Med 54:16–23 . https://doi.org/10.3414/ME13-02-0024 Cite Download
Lim Choi Keung SN, Zhao L, Rossiter J, McGilchrist MM, Culross F, Ethier J-F, Burgun A, Verheij R, Khan N, Taweel A, Curcin V, Delaney BC, Arvanitis T (2014) Detailed clinical modelling approach to data extraction from heterogeneous data sources for clinical research. AMIA Jt Summits Transl Sci Proc 2014:55–59 . https://doi.org/10.13140/2.1.4064.1921 Cite Download
Ethier J-F, Dameron O, Curcin V, McGilchrist MM, Verheij RA, Arvanitis TN, Taweel A, Delaney BC, Burgun A (2013) A unified structural/terminological interoperability framework based on LexEVS: application to TRANSFoRm. J Am Med Inform Assoc 20:986–994 . https://doi.org/10.1136/amiajnl-2012-001312 Cite Download
St-Arnaud C, Ethier J-F, Hamielec C, Bersten A, Guyatt G, Meade M, Zhou Q, Leclair M-A, Patel A, Lamontagne F (2013) Prescribed targets for titration of vasopressors in septic shock: a retrospective cohort study. CMAJ Open 1:E127-133 . https://doi.org/10.9778/cmajo.20130006 Cite
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Ecarot T, Fraikin B, Ouellet F, Lavoie L, McGilchrist M, Ethier J-F (2020) Sensitive Data Exchange Protocol Suite for Healthcare. In: IEEE Symposium on Computers and Communications. Rennes, France Cite Download
Ecarot T, Dussault S, Souid A, Lavoie L, Ethier J-F (2020) An AppArmor For Heath Data Access Control: Assessing Risks and Benefits. In: Proceedings of the  2020 Seventh International Conference on Internet of Things: Systems, Management and Security (IOTSMS). Paris Cite Download
Barton A, Toyoshima F, Ethier J-F (2020) Approaching Roles with Affordances. In: Proceedings of the Joint Ontology Workshops. CEUR Workshop Proceedings, Virtual & Bozen-Bolzano, Italy, p 14 Cite Download
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Barton A, Grenier O, Jansen L, Ethier J-F (2018) The identity of dispositions. In: Borgo S, Hitzler P, Kutz O (eds) Formal Ontology in Information Systems. Proceedings of the 10th International Conference (FOIS 2018). IOS Press, Cape Town, Afrique du Sud, pp 113–126 Cite Download Download
Barton A, Jansen L, Ethier J-F (2018) A taxonomy of disposition-parthood. In: Galton A, Neuhaus F (eds) Proceedings of the Joint Ontology Workshops 2017, CEUR Workshop proceedings. CEUR Workshop Proceedings, Bolzano, Italie, pp 1–10 Cite Download
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Vanasse A, Dault R, Cloutier A-M, Benigeri M, Ethier J-F (2019) Validated case selection algorithms to identify 7 ambulatory case sensitive conditions Cite Download
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Vanasse A, Ethier J-F, Dault R, Benigeri M, Cloutier A-M (2019) Validated case selection algorithms to identify 7 ambulatory care sensitive conditions Cite
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Beaudoin A-A, Dault R, Barton A, Cumyn A, Cloutier A-M, Ethier J-F (2018) Initiative CLARET: consentement pour l’utilisation secondaire des données médicales en recherche Cite
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Khnaisser C, Lavoie L, Burgun A, Ethier J-F (2016) Méthode de construction d’entrepôts de données temporalissées guidée par les ontologies Cite Download
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Quirion R, Plante J-F, Rousseau L-M, Ethier J-F (2016) À la recherche du patient au coeur des données massives — Looking for the patient at the core of big data Cite
Barton A, Taseen R, Ethier J-F (2015) PDRO: une ontologie des prescriptions médicales Cite
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Curcin V, Arvanitis TN, Ethier J-F, Fraczkowsk K, Kazienko P, Brodka P, Andreasson A, Blizniuk G, Lim Choi Keung SN, Zhao L, Misiaszek A, McGilchrist MM, Delaney BC, Burgun A (2014) Semantic approach to achieving interoperability between clinical care and clinical research Cite Download
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Lim Choi Keung SN, Zhao L, Rossiter J, Ogunsina I, Curcin V, Danger R, McGilchrist MM, Ethier J-F, Ohmann C, Kuchinke W, Taweel A, Delaney BC, Arvanitis TN (2013) Provenance-aware query formulation tool to identify eligible clinical research participants Cite
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Khnaisser C, Lavoie L (dir.) et Ethier J-F (dir.) (2016) Méthode de construction d'entrepôt de données temporalisé pour un système informationnel de santé. Mémoire de maitrise, Université de Sherbrooke Cite Download
Ethier J-F (2016) Integrating resources for translational research: a unified approach for learning health systems. Thèse de doctorat, Université Pierre-Marie Curie - Paris VI Cite Download

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