Paul Fabry

Paul Fabry - GRIIS

Doctorant en informatique, sous la supervision du Pr Jean‑François Ethier et d’Adrien Barton

Médecin de famille de formation, Paul Fabry possède une expérience universitaire et professionnelle en informatique médicale. Dans le cadre de son doctorat en informatique, il s’intéresse à la modélisation des connaissances médicales à l’aide d’ontologies, aux problèmes liés à la maintenance et à l’évolution de ces ontologies ainsi qu’aux outils informatiques facilitant la pratique réflexive en milieu clinique.

Paul Fabry a été analyste informatique à la Direction des ressources technologiques et informationnelles (DRIT) du CIUSSS de l’Estrie — CHUS. Aussi, il a été directeur éditorial et responsable de l’équipe d’assurance qualité du projet de traduction en français de la terminologie SNOMED CT® (Centre d’expertise en santé de Sherbrooke et Inforoute Santé Canada). Il a occupé divers postes en recherche au CHUS et au Service d’informatique médicale des hôpitaux universitaires de Genève.

Formation

Études de maitrise, Université de Sherbrooke, génie logiciel (passage accéléré au doctorat)

Microprogramme de 2e cycle, Université de Sherbrooke, pédagogie des sciences de la santé

M.D., Université de Bretagne occidentale, doctorat en médecine

DEA, Université Pierre et Marie Curie — Paris 6, informatique médicale et technologie de la communication

D.E.S.S., Université de Rennes 1, traitement de l’information médicale et hospitalière

Publications

Ethier J-F, Goyer F, Fabry P, Barton A (2021) The prescription of drug ontology 2.0 (PDRO): More than the sum of its parts. International Journal of Environmental Research and Public Health 18. https://doi.org/10.3390/ijerph182212025 Cite
Barton A, Fabry P, Ethier J-F (2024) Meaning Holism and Indeterminacy of Reference in Ontologies. In: Proceedings of the 14th International Conference on Formal Ontology Information Systems (FOIS 2024). Enschede, Pays-Bas Cite Download
Fabry P, Barton A, Ethier J-F (2023) Version control for interdependent ontologies: Challenges and first propositions. In: Proceedings of the International Conference on Biomedical Ontologies 2023 together with the Workshop on Ontologies for Infectious and Immune-Mediated Disease Data Science (OIIDDS 2023) and the FAIR Ontology Harmonization and TRUST Data Interoperability Workshop (FOHTI 2023). Brasilila, Brésil, pp 154–165 Cite
Goyer F, Fabry P, Barton A, Ethier J-F (2022) An ontology for healthcare systems. In: Proceedings of the 13th International Conference on Biomedical Ontology (ICBO 2022). Ann Arbor, États-Unis Cite
Toyoshima F, Barton A, Fabry P, Ethier J-F (2022) Representing Gender in Ontologies: A Dispositional Perspective. In: Proceedings of the 12th International Conference on Biomedical Ontology (ICBO 2021). CEUR Workshop Proceedings, Bolzano, Italie, pp 1–12 Cite Download
Fabry P, Goyer F, Barton A, Ethier J-F (2022) An informational perspective on the ontology of services. In: CEUR Workshop Proceedings Cite
Fabry P, Goyer F, Barton A, Ethier J-F (2021) An Ontological Analysis of Health Procedure Information. In: Proceedings of the 12th International Conference on Biological Ontology (ICBO 2021). CEUR Workshop Proceedings, Bolzano, Italie, pp 36–47 Cite
Barton A, Toyoshima F, Vieu L, Fabry P, Ethier J-F (2020) The Mereological Structure of Informational Entities. In: Brodaric B, Neuhaus F (eds) Proceedings of the 11th International Conference (FOIS 2020). IOS Press Cite Download
Fabry P, Barton A, Ethier J-F (2020) QUESTO – An ontology for questionnaires. In: ICBO|ODLS 2020 International Conference on Biomedical Ontologies 2020. CEUR-WS.org, Bolzano, Italie, p B.1-12 Cite Download
Fabry P, Barton A, Ethier J-F (2020) An Ontological Representation of Sex and Gender Information. In: Hastings J, Loebe F (eds) ICBO|ODLS 2020 International Conference on Biomedical Ontologies 2020. CEUR-WS.org, Bolzano, Italy, p O.1-5 Cite Download
Barton A, Fabry P, Ethier J-F (2019) A classification of instructions in drug prescriptions and pharmacist documents. In: Proceedings of the 10th International Conference on Biomedical Ontology (ICBO 2019). CEUR Workshop Proceedings, Buffalo, États-Unis, pp 1–7 Cite
Barton A, Fabry P, Lavoie L, Ethier J-F (2019) LABO: An ontology for laboratory test prescription and reporting. In: Proceedings of the Joint Ontology Workshops 2019 (JOWO 2019). Graz, Autriche, pp 1–9 Cite
Fabry P (2021) Vers une ontologie des procédures de santé Cite Download
Ethier J-F, McGilchrist MM, Fabry P (2021) Introduction to Formal Ontologies Cite
Fabry P, Barton A, Ethier J-F (2019) LABO: an ontology for laboratory test prescription and reporting Cite Download Download